西元一六三八年正月，日本九州。岛原湾口，岛原半岛和天草列岛之间的海面上，无数的船只密密麻麻地排列着，死死封锁着进出岛原半岛上的岛原城的海上通道。这是一个全世界陷入战火的年代。欧洲陷入宗教战争，正在血流成河；在西亚，奥斯曼帝国在和波斯开战；在南亚，莫卧儿帝国的沙贾汗东征西讨；明朝内有大规模农民起义，外有清军连番入寇；世界各地的欧洲殖民者，也是既互相残杀，又和当地人争斗。日本也同样处于动乱之中，气候变化引发了大饥荒，而领主们依旧对吃草根啃树皮的百姓暴敛横征，岛原的农民竖起义旗，占据岛原城，反抗幕府的统治。